Il a été construit 16 Tu-144 en état de vol, à savoir :
1 prototype Tu-144 (no 68001)
1 Tu-144S de préproduction (no 77101)
9 Tu-144S de production (no 77102 à 77110) dont 1 reconverti en Tu-144D
5 Tu-144D améliorés (no 77111 à 77115) dont 1 reconverti en Tu-144LL
Un dernier avion reste inachevé et ne vola pas ; il a été stocké à l'usine de Voronezh, jusqu'en 1995 et fut ferraillé. Il y a eu au moins une cellule supplémentaire pour les essais statiques au sol en parallèle avec le développement du prototype no 68001.
Parmi les 16 appareils entièrement construits, 7 sont préservés, 7 ont été ferraillés et 2 se sont accidentés. Cela représente 43,75 % des appareils qui existent encore ; par comparaison, 90 % des Concorde sont préservés.
Le CCCP-77112 au musée automobile et technologique de Sinsheim
Le RA-77114 en vol en 1998
Le CCCP-77115 à MAKS 2007
00-1 (CCCP-68001) fut le prototype du Tu-144, ainsi que le premier supersonique civil au monde à voler, le 31 décembre 1968 ; vol d'une durée de 37 minutes. Cet appareil franchit le mur du son (Mach I) le 5 juin 1969 et Mach II le 26 mai 1970. Il participa au 29ème Salon du Bourget en 1970 où il rejoignit le Concorde pour la première fois. Il fit son dernier vol le 27 avril 1973 vers Zhukovsky et fut ferraillé en 1977.
01-1 (CCCP-77101) était l'appareil de pré-production. Il vola pour la première fois le 1er juin 1971. Cet appareil était légèrement différent du prototype ; l'aérodynamique fut amélioré, les ailes modifiées, leur surface augmentée et le fuselage a été allongé. Un autre changement important a été la nouvelle configuration des moteurs en deux nacelles séparées avec deux moteurs de chaque côté. La masse au décollage a été poussée à 190 tonnes. Cet appareil a été ferraillé en 1985.
01-2 (CCCP-77102) était le premier Tu-144 de production. Il participa au 30e Salon du Bourget et s'écrasa le 3 juin 1973 à Goussainville.
02-1 (CCCP-77103) fit son premier vol le 13 décembre 1973. Il fut utilisé dans une série de vols dans différentes villes d'URSS où furent testés la navigation et le système de vol. Il a été ferraillé en 1984 à Zhukovsky.
02-2 (CCCP-77144) était d'abord immatriculé CCCP-77104. Il a fait son premier vol le 14 juin 1974, a participé au Salon du Bourget en 1975. Cet appareil fut ferraillé en 1987 à Zhukovsky.
03-1 (CCCP-77105) a volé pour la première fois à Voronezh le 30 novembre 1974. Cet appareil est le premier à recevoir les nouveaux moteurs Koliesov RD-36-51 du Tu-144D, en 1976. Il fit le plus long vol d'un Tu-144 avec une distance de 6200 km. Il a été retiré des vols d'essais en 1978, abandonné près de Zhukovsky et fut finalement ferraillé en 1993.
04-1 (CCCP-77106) est le plus ancien Tu-144 préservé. Il a fait son premier vol le 4 mars 1975 à Voronezh. Son dernier vol se fit pour être livré au Central Air Force Museum(en) à Monino où il est actuellement exposé.
04-2 (CCCP-77108) n'a jamais été exploité par Aeroflot. Cet appareil ne fit que 50 vols, d'une durée de 68 heures et ne passa que 6 heures à vitesse supersonique. Il se trouve au musée de Samara State Aerospace University.
05-1 (CCCP-77107) a fait son premier vol le 20 août 1975. Son dernier vol, vol de livraison à l'institut d'aviation du Kazan State Technical University(en) où il est visible, se fit le 29 mars 1985.
05-2 (CCCP-77109) fut l'un des deux appareils utilisés pour des vols commerciaux sur la routeMoscou - Alma-Ata. Il fut entreposé à l'usine de Voronezh suite à l'arrêt du service et fut ferraillé en 1995 avec le no 77116.
06-1 (CCCP-77110) était le second appareil qui fit des vols commerciaux avec le CCCP-77109 sur la même route. L'appareil se trouve à Ulyanovsk au musée de l'aviation civile.
06-2 (CCCP-77111) ne fit que 5 vols pour une durée totale de 9 heures. Il réalisa un atterrissage forcé à Iegorievsk, suite à un incendie à bord, le 23 mai 1978, moins d'un mois après son premier vol.
07-1 (CCCP-77112) a été racheté par le musée automobile et technologique de Sinsheim. En octobre 2000, le nez, les ailes, la dérive et la queue ont été retirés et l'avion fut transféré sur une barge pour un voyage de Moscou jusqu'à Sinsheim en passant par la mer Baltique. Il est exposé avec le Concorde Fox-Bravo (F-BVFB) sur le toit du musée.
08-1 (CCCP-77113) subit une destruction d'un moteur en vol, à vitesse supersonique, le 31 août 1980. L'équipage avait dû faire un atterrissage d'urgence à la Engels Air Force Base(en). Il a été ferraillé en 2001 à Zhukovsky.
08-2 (RA-77114) a été choisi pour servir de banc d'essais dans un programme commun entre Tupolev et la NASA. Il fut entièrement transformé ; les anciens moteurs RD-36-51A ont été remplacés par des NK-321 équipant le Tu-160. L'appareil fut rebaptisé Tu-144LL Flying Laboratory. Cette nouvelle version fit son premier vol le 29 novembre 1996. Il fut le dernier Tu-144 à voler, le 14 avril 1999 avec un vol autour de Zhukovsky. Il reste à Zhukovsky mais n'est plus en état de vol.
09-1 (CCCP-77115) est le dernier appareil achevé. Il fit son premier vol le 4 octobre 1984 à Voronezh. Il a été désigné pour être converti en Tu-144LL mais la conversion n'a jamais été réalisée. Il reste entreposé à Zhukovsky.
09-2 (CCCP-77116) n'a jamais été achevé et ne vola pas. Il devait être enregistré comme CCCP-77116. La carcasse resta entreposée à Voronej et fut ferraillée en 1995.